研究发现，饭后立即吃水果容易导致水果在胃中滞留，使得果糖与胃酸作用而导致吃下的米饭过度发酵，产生大量的气体，而这会导致腹胀、打嗝或是肠胃不适。因此，吃水果宜在饭后2小时或饭前1小时。
水果所含的主要成分是维生素C，而维生素C可与铜离子发生作用，会产生一种不稳的化合物。因此过量食用水果，会使人体缺铜，从而导致血液中胆固醇增高，长期这样可能引起冠心病，因此不宜在短时间内进食水果过多。
吃完水果后，口腔内会有大量的唾液分泌，造成食物降解，而这个过程相对来说酸细菌会相对活跃起来，造成牙齿表面一次性的矿脱落。而在这个时候刷牙，会导致牙齿特别敏感、龋化。一般来说，吃完食物后5~10分钟左右是刷牙的最佳时间。
水果是维生素C的主要来源，维生素C容易在空气中氧化。英国消费者协会做过一项研究，测试在超市售卖的预先包装的切开蔬果的维生素C含量，发现13个样本中，4个样本的维生素C含量比参考书记载的维生素C含量低一半。
不要吃有腐烂部分的水果
腐烂水果会产生对人有致癌、致畸等毒害作用的毒素，有的可引起脑及中枢神经系统的损害。在距离腐烂部分一厘米的正常水果圈里，仍可检出毒素，所以最好吃新鲜水果。如果发现果体有小块腐烂，要用刀挖去腐烂及周围至少超过1厘米的好果肉部分，如果腐烂超过1/3，请不要食用。
因菜刀常接触肉、鱼、蔬菜，一些生肉里面可能存在部分寄生虫，如果将切肉的菜刀用于切水果就有可能使人感染寄生虫病。所以切水果最好用水果刀，即使用菜刀也需要用热水处理一下。
