急性肠胃炎多是因为饮食不洁所致，比如食用了被苍蝇、带菌者或患者污染了食物，饮用生水、生肉、变质或冰箱中过期了的食物等，这样的食物中存有有害细菌，比如葡萄球菌、沙门杆菌等，从而导致胃肠炎的发生。
病毒感染往往也可以引发肠胃炎;轮形病毒是引起儿童肠胃炎的最常见的病原体;可以导致胃肠炎的病毒还有腺病毒、肠病毒、手足口病毒等等;如果是这些病毒引起的胃肠炎，在感染后的两天内就会发病。
物理因素如进食过热、过冷粗糙的食物，X线照射等，化学因素如烈酒咖啡、浓茶、香料及某些药品，均可损伤胃粘膜，引起炎症性改变。
精神、神经功能失调，各种急重症的危急状态，以及机体的变态(过敏)反应均可引起胃粘膜的急性炎症损害。
