华佗再造丸的副作用尚不明确。
华佗再造丸的副作用有极个别的患者在服药后出现了纳差、便秘、灼热、咽干口苦、心烦易怒等不适症状。不过，通常情况下，这些不适症状不严重，同时在服用白菊蜜糖水服用药品后，部分不适症状可缓解，在停药后几乎全部不适症状都可以自行消退，所以患者朋友们不必过分担心。
1. 中风后遗症表现有半身不遂、言语蹇涩、口眼歪斜、肢体麻木，兼见舌苔白或腻、舌质紫暗、脉涩或弦滑等辨证属于瘀血阻滞或风痰阻滞经络所致者。
2. 缺血性中风表现为头晕、一侧肢体麻木或无力、休息后突然出现肢体不灵活或偏瘫、口眼歪斜、言语不清，或素有心脏病突然出现短暂的意识障碍、偏瘫、失语、舌紫暗、或有瘀点瘀斑、舌苔腻、脉涩或滑。辨证属于瘀血阻滞或痰湿闭阻经络者。
3. 头痛、眩晕表现为经常头痛、眩晕、手足麻木，或高血压者头昏、行动迟缓、易哭易笑、舌质暗红、脉弦。辨证属于肝肾阴虚、筋脉失养、气血瘀滞者。
4. 胸痹症见胸闷如窒、心悸、胸痛或痛引肩背、舌紫暗或有瘀点、苔浊腻、脉弦涩或濡缓或滑。辨证属于气滞血瘀成痰浊阻络者。
5.风湿寒痹对因风寒邪气杂至、闭阻经络、气血运行不畅所致的肌肉、筋骨关节酸痛、麻木、屈伸不利的痹症。
