百日咳恢复期的时候一般是可以接种疫苗的，如果孩子的百日咳病毒已经被消灭，现在只有部分的病毒蛋白在体内引起的恢复期反应，这种情况下是可以进行育苗的接种的。
百日咳的疫苗主要分为以下三种，目前我国常用的是使用百白破疫苗。
百日咳疫苗有良好预防效果，是最先纳入计划免疫的疫苗之一。经广泛应用后发病率明显下降，免疫后的血清抗体凝集效价在1：320(保护水平)以上者可达80%-90%。无细胞百日咳疫苗可达到90%以上。
婴儿出生后满3个月开始接种第一针。第一针是要完成该疫苗的基础免疫的，还需在出生后满4个月和满5个月时再各接种一次，也就是加强在婴儿体内产生了抗百日咳、白喉和破伤风三种传染病的抗体。
需要加强免疫的，还需要在1岁半至2周岁时再用百白破疫苗加强免疫1针，7周岁时用精制白喉疫苗或精制白破二联疫苗加强免疫1针。
