精液常规检查能查出男性精子的色、量、液化时间、酸碱度、精子计数、活动力、存活率及形态等，是确诊男性少精必须做的检查项目。
当男性3次精液常规检查结果都是精子密度低于2000万者，可确诊为少精症。
少精症患者还需要注意做体格检查，包括全身及生殖器官检查。
全身检查要特别注意检查发育、营养及精神状况，生殖器检查内容主要包括前列腺、阴茎、睾丸、尿道、精索等部位的检查。
染色体异常也是导致男性少精症的病因之一，所以少精症患者还应进行染色体检查，确诊是否是染色体异常所致。
一般来说，精子密度低于1000万/毫升的患者，都应做染色体检查。另外，Y染色体上与生精有关的基因-无精子因子有微缺失时，也会导致患者出现严重少精子甚至无精子。
内分泌异常也是导致男性少精症的原因之一，做内分泌检查可帮助排除或确诊病因。
内分泌检查是通过刺激试验可以了解下丘脑-垂体-睾丸轴的功能，测定睾酮水平可以直接反映间质细胞的功能。
通过超声检查可诊断男性少精是否是精索静脉曲张造成的，若确诊常用手术治疗。
