同卵双胞胎是在发育初期时分开。
同卵双胞胎是指一个受精卵在发育初期分裂成两个胚胎，而形成双胞胎。同卵双胞胎是卵在受精后，受精卵因为不明原因自行分裂后再分开形成的。受精后的胚胎事实上仍被一层透明带包围，接着才会破茧而出，此时便是分裂为同卵双胞胎的重要时刻，若突破透明带的时间不同，便会产生不一样的结果。所以说，同卵双胞胎是在发育初期时分开。
a.受精后三天内分裂，会产生两个绒毛膜腔(又称为”滋胚层外膜”)、两个羊膜腔。之后两个胚胎各自发展、不互相影响，为最好的情况。
b.受精后三天以上、8 天以内分开，即产生一个绒毛膜腔及两个羊膜腔。胚胎因为彼此胎盘血管可能互相连通，造成胎儿的血液由一个传递给另一个的危险状况，称作”双胞胎输血症候群”。
c.受精后8 天以上才分裂会只产生一个绒毛膜腔、一个羊膜腔。双胞胎因为同属一个空间，所以脐带容易打结，胎儿死亡机率相对提高。
d.受精后13 天以上才分裂则产生连体婴。
同卵双胞胎不是完全一样的。
同卵双胞胎的长相、性格、身材等等方面同卵双胞胎让人很难分辨开来，但同卵双胞胎的dna与指纹是不一样的。虽然过去的研究已经着眼于研究精子和卵子中的能够传递给后代的基因变化或者基因突变，很少有研究着重于体细胞突变。这些突变也被称作复制误差，能够发生于胎儿发育的早期，但是由于它们并不存在于胎儿的生殖细胞中，所以它们不能传递给后代。
其它的研究已经表明那种化学改变或者说表观遗传效应能够随着时间改变基因表达，这个因素致使双胞胎并不完全相同。然而其它的研究也表明同卵双胞胎拥有不同的基因突变，但是这项研究并未断定它们发生的频率。
比如说，一个双胞胎或许在一个点携带着一个A，而另一个双胞胎则携带着一个C。研究人员们只能够确定在胎儿发育很早的阶段就会出现差异而且出现在身体中的大多数细胞中。
同卵双胞胎多久才分开：如何鉴定同卵还是异卵
首先，如果双胞胎的性别不同，那么他们肯定是异卵双胞胎(除了2001年出生的一对半同卵双胞胎，其中一个为男性，另一个为雌雄同体)。如果性别相同，那么还需要进一步的区分。出生时，医生可能会告诉您，两个孩子是一个胎盘或是两个胎盘。一个胎盘说明是同卵双胞胎，两个胎盘就是异卵双胞胎。但这种概念是错误的。虽然，胎盘、胎膜的状况与双胞胎的卵性有一定关系，但不是绝对的，所以不能单单根据这个来判断。
一般人们会通过相貌来判断，有的双胞胎就像一个模子里刻出来似的，他们多半是同卵双胞胎，长得不太像的则多半是异卵双胞胎。这种方法确实有一定的科学依据，我们称这种方法为相似法。但是，单靠相貌还远远不够，还必须包括一些其他特征，如皮纹、头发的颜色、头发的形式和密度、眼虹膜的颜色和结构、前后发际、耳垢、耳廓、鼻形、脸形、唇形、眼睑、齿列、有无中指毛、皮肤的颜色和结构、雀斑、苯硫脲(PTC)的尝味能力等。看来，这种方法也比较麻烦。
相似法还可以通过血型鉴定来实现。一般必须联合测定几种血型，如ABO、P、MN、S、Rh等，测定的血型越多，准确性越高。有一种及以上的血型不同，则为异卵双胞胎。如果全部相同，则可以在一定的概率水平下说他们是同卵双胞胎。
另一种更可靠的方法就是鉴定DNA。其工作原理和亲子鉴定的差不多。一般，同时测定9个基因位点，鉴定结果的可靠性可以达到99%以上。双胞胎只需要提供很少的血液，就可以完成鉴定。这种工作在法医鉴定中心即可完成。
同卵双胞胎发生的机率不会随着种族、遗传或者环境的不同而改变，大约为4/1000;异卵双胞胎受到多种因素控制，尤其是种族与遗传，当然也跟最近利用排卵药治疗不孕症有关系，另外还会受到环境因子的影响。根据医学调查，黑人的发生率最高，例如在奈及利亚的某些土著部落中甚至高达20分之1的比率，白种人则次之，约为1%，亚洲人较为罕见，只有1/100~200。其他像是高龄产妇、母亲生产次数较多或是母亲体型较胖、较高，都容易产下异卵双胞胎，另外，如果母亲或其家族曾产下双胞胎，则更易怀有双胞胎，所以母亲的基因影响可能比父亲来得重要。
