患儿可伴发脾肿大，淋巴结肿大，心包炎，胸膜炎，贫血，弥散性血管内凝血，肠系膜淋巴结病变或腹膜炎，惊厥等，反复发作可致发育迟缓。
患儿可伴发声哑，喉喘鸣和饮食困难，类风湿因子阳性多关节型JRA患儿可伴发类风湿性血管炎，并发干燥综合征及Fetly综合征。
患儿可因关节周围组织挛缩，导致屈曲障碍，发生双腿长度不等而呈跛行，可并发慢性虹膜睫状体炎，继发性青光眼，白内障，导致严重视力障碍或失明，可伴发于强直性脊柱炎，炎症性肠病和瑞特病等。
1、本症病程可迁延数年，急性发作及缓解交替出现，大多数到成年期自行缓解。但也有少数仍持续发作。如关节炎多年不愈，可造成严重关节畸形，活动障碍，此多见于多关节炎型，发病年龄较大的女孩及全身型伴有多关节炎者。
2、少关节炎型，在4岁前发病的女孩，多发生慢性虹膜睫状体炎，造成失明。
3、强直性脊椎炎可见于发病年龄较大的男孩。
总的来说，如能及时治疗，75%患者病情缓解，关节功能正常。只有少数造成终身残废。个别患者合并感染或淀粉样变性而死亡。淀粉样变性较多见于全身型病例。
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