8岁以下孩童对咖啡因代谢较速度慢，吃了含咖啡因的巧克力，可能会过度亢奋晚上不易入睡。此外，黑巧克力所含的脂肪及糖分，并不是孩童生长发育的必要来源，吃多了容易肥胖。
造成胃灼热感的主要原因是酸性的食糜、胃液等刺激性物质从胃逆流到食道。
研究发现，有些食物会让食道和胃之间，负责把关工作的贲门变得松弛，失去阻隔食物逆流的功能，而巧克力正是其中之一。
另有研究指出，巧克力含有至少4种容易引起贲门松弛的物质，包括咖啡因、可可硷、茶硷及脂肪。再者，巧克力添加的糖属于精制糖类，吃进胃裡会刺激大量胃酸分泌，诱发胃食道逆流症状，因此，长期有胃灼热困扰、胃食道逆流的人，还是尽量远离巧克力。
巧克力中的咖啡因会经由胎盘及母乳传给胎儿、婴儿，怀孕或哺乳的妈妈若摄取超过300毫克咖啡因，会影响胎儿或婴儿脑部发育，要特别留意。
容易头痛的人
巧克力虽然滋味迷人，不过它内含的酪胺却是引人头疼的罪魁祸首。下次头疼又犯，除了找个方法放松心情外，最好少吃各种巧克力製品(包括巧克力冰淇淋、布丁、饼干等)，其他如含酒精饮料(特别是红酒)、乾乳酪、腌熏的猪肉、鱼肉及加了酵母的面包、蛋糕，也最好少吃。
其实黑巧克力的热量并不低。其中的可可脂仍有脂肪，而1公克的脂肪可产生9卡热量，因此，反而可可脂含量越高，也就是越纯的黑巧克力，热量相对也高，不建议三高患者及肥胖者食用，一般民众如果吃黑巧克力，每天不应超过30克，以避免吃进过多热量。
