保婴丹去除了朱砂、雄黄等有毒药材，但当中的法半夏、淡全虫也有微量毒性，不宜长期过量服食。此外，这种药从成分组成上看，偏于苦寒，用法不当可能造成腹泻，寒性体质和受风寒拉肚子的孩子都不建议服用。
大部分保婴丹成分里含有用于定惊的朱砂，它含有汞元素，虽然剂量小，单次使用影响有限，但若长期大量服用，会导致毒素在体内积累，从而影响大脑神经的发育。
保婴丹有什么副作用：伤肾
保婴丹中含冰片和少量朱砂，具有安神、定惊等功效，但它们具有一定的毒性。婴幼儿的药物代谢功能有限，如果过量或长期使用，可能在血液和肾脏中蓄积，伤害未发育完全的泌尿和神经系统。如果使用保婴丹3天左右效果不明显，甚至病情加重，如孩子出现不明原因的啼哭、面色发白等 症状，应及时停药，并到医院就诊。
1、初生至一个月内婴儿：每日一次，每次半樽。
2、一个月至两岁婴儿：每日一次，每次一樽。
3、两岁或以上小孩小童：每日一次，每次两樽，可连服多日。
4、如作保健用途， 可每星期服用一次，服量如上。如病情持续，请遵医嘱，请按时以温水调服。
注意事项：婴孩忌食生冷荤腥，油腻燥热之物。保婴丹不适宜患有先天性六磷酸葡萄糖去氢酵素缺乏症之婴孩服用。
