早期结核性附睾炎可以用药物进行治疗，常用的药物有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、链霉素、乙胺丁醇等，可以酌情选择3～4种药物联合应用。
一般疗程为6～9个月，治疗期间一定要定期检查肝功能、肾功能，进行视力、视野的检查，以防止药物副作用的发生。
早期附睾结核药物治疗即可治愈。如果没治愈，出现局部干痨样坏死严重，累及睾丸，病变较大并有脓肿形成或药物治疗效果不明显，则可行附睾切除。
附睾局部硬节抗结核治疗无效，或在治疗的过程当中结节逐渐增大，可以手术治疗，附睾切除术前2周应用抗结核的药物，术后继续应用抗结核的药物达6个月左右。
若附睾有病变，病变靠近睾丸，则可连同附睾将睾丸部分切除。不过一般建议尽量保留睾丸。附睾切除后，精囊和前列腺结核多能逐渐愈合。
这类病者治疗期间要注意多休息，避免劳累。其次饮食要清淡营养，少吃辛辣刺激、高脂肪、高胆固醇的食物。
