不干净的麻辣小龙虾会导致腹泻、中毒等。小龙虾生长环境比较环境较恶劣，一般生长在沟里面，身体里含有许多的细菌、寄生虫，然而做龙虾的时候有些商家并没有把小龙虾的体内的脏东西全部放出来，就下锅了。这样对身体一点好处也没有，除了过过嘴瘾，拉肚子什么的都是比较轻的了。更甚者有一些黑心商人为了缩短龙虾的养殖周期，会加入一些化学铅和一些别的有害物质。所以，吃麻辣小龙虾还是要慎重，干净是最重要的。
小龙虾是一种高蛋白食物，蛋白质摄入过量会出现异种蛋白反应，就可能造成全身过敏，出现红色的风疹团。麻辣小龙虾吃多了对胃部造成负担。小龙虾，虽然含有丰富的蛋白质，具有补肾滋阴壮阳的功效，但是如果吃多了的话，对身体只有坏处，没有好处，尤其会对胃部，造成巨大的负担。
小龙虾是肺吸虫的第二中间宿主，在烹饪时若未煮熟煮透，或采用烤、炒、腌、醉等形式烹饪，人食用后就有可能感染肺吸虫病，容易造成“横纹肌溶解症”。一般来讲，小龙虾和蟹这类动物都携带肺吸虫，而且用烤、炒或者腌的方法不能保证将肺吸虫的幼虫杀死。所以，吃小龙虾一定要煮熟煮透才行。不熟透的麻辣小龙虾可是会携带疾病的。
麻辣小龙虾如果烧煮时间短，细菌未被完全杀灭，极有可能造成食物中毒。由于市场需求量大，目前的小龙虾基本都从外地购进，在夏季高温气候下再经过长途运输，死亡的小龙虾不在少数，个别饭店甚至将死龙虾用油炸过后出售。由于小龙虾体内含大量组氨酸，一旦小龙虾死亡，组氨酸会转化为有毒物质。虽然少量食用不会马上引起中毒，但日积月累会因为毒素积累引发疾病。
1、麻辣小龙虾不能吃头。小龙虾体内含有大量细菌和寄生虫，同时含有大量重金属物质，但是基本都在头部内。所以食用时一定要去头!切不可贪图省钱将头部一并食用。鉴于大部分饭店为了省事出售的小龙虾基本都是含头的，那么食用时一定要将头部摘除掉不可食用。
2、麻辣小龙虾虾线必须要除去。虾线一定要去除，这个部位是仅次于头部第二脏的地方。很多饭店也是为了省事并没有去除虾线，因此建议大家尽可能的要买回家来自己做着吃。
3、麻辣小龙虾一定要煮熟。小龙虾烹饪时间要足够，不能小于20分钟。外面的商家为了节省燃料费用和时间成本，很多的烹饪时间是不够的，这是有卫生安全隐患的。因此自己在家做麻辣小龙虾一定要煮熟了才吃。
4、麻辣小龙虾忌与某些水果同吃。小龙虾含有比较丰富的蛋白质和钙等营养物质。如果把它们与含有鞣酸的水果，如葡萄、石榴、山楂、柿子等同食，不仅会降低蛋白质的营养价值，而且鞣酸和钙离子结合形成不溶性结合物刺激肠胃，引起人体不适，出现呕吐、头晕、恶心和腹痛腹泻等症状。
