野生鲫鱼的脊背颜色较深，呈青色，鳞片颜色比较浅，常常发白而且略带金属光泽，阳光下可以出现金光;养殖的鲫鱼鳞片灰白，无光泽感。如果鲫鱼的背部颜色比较浅，甚至还偏黄的话，那多半就是野生的鲫鱼无疑。
野生鲫鱼的脑袋比较小，而且呈尖三角，由腮部锐减，出现明显弯曲;相反养殖的鲫鱼鱼头比较庞大肥硕，由腮部到头部口腔连接处比较浑圆。
另外养殖鲫鱼往往看上去就比较肥硕，通常身体都更偏向于圆形，而野生鲫鱼往往身体比较细长。另外野生鲫鱼的背部凸起比较明显，而养殖鲫鱼背部则比较平滑。
野生鲫鱼由于生长环境比较自然，受到的化性激素污染比较少，所以鱼鳃呈现出比较自然的鲜红色;相反的养殖的鲫鱼鱼鳃颜色比较暗，发黑色。
由于生长环境和摄取食物的差别，野生鲫鱼口腔内部颜色为白色或淡绿色;相反的养殖的鲫鱼由于长期接触饲料，口腔内的颜色多为灰色或灰黑色。
