加味香连丸的副作用尚不明确。
加味香连丸的主要成份是木香、姜黄连、黄芩、黄柏(酒炙)、白芍、当归、姜厚朴、麸炒枳壳、槟榔、醋延胡索、制吴茱萸、炙甘草。为纯中药制剂，副作用相对来说是比较小的，一般来说，是药三分毒，建议最好不要长期使用加味香连丸，最好在医生的指导下按照疗程用药，效果会比较理想的。
1、在使用期间不要食用生冷、辛辣、油腻等不容易消化及带有刺激性的食物;
2、在使用期间不要抽烟，不要喝酒，烟、酒会对脾胃肾等器官有一定的刺激作用;
3、对加味香连丸过敏的患者不可以使用;
4、具有慢性虚寒性泄痢疾的患者要在医生的指导下服用;
5、加味香连丸很容易伤到脾胃，不可以过多服用、长久服用;
6、将加味香连丸放置在阴暗通风的地方，并且要避免儿童接触，以免儿童误食。
