哈密瓜籽中含多种药用生理活性成分和生物活性物质，具有补肾填精、增强性欲、健胃、消食、修复肠胃溃疡、润肺生津、止咳化痰、清理肾脏、利尿排石、活血散瘀、可接筋骨等功效。(载自《本草纲目》《药物之源》《维吾尔药卷》)
哈密瓜籽有很强的抗氧化活性，用其提炼出的精油有好的美容功效。比如有极强的保湿效果，可使皮肤更滋润细腻，另外还有显著的祛斑功效，能帮助消除各种黑斑。
能吃。
哈密瓜籽没有毒性，所以是可以食用的，不过因其口感较硬，很多人都不喜欢吃，所以习惯了去籽食用。
直接吃
哈密瓜若是还没有完全成熟，其籽也还没变老，不是很硬时，可连籽和果肉一起食用。
炒着吃
哈密瓜的籽若是已经成熟，就可像南瓜子一样，先收集起来，并用清水冲洗干净，然后晒干，加点盐炒熟，像吃南瓜子或葵花籽一样食用。
