南瓜籽油含有丰富的不饱和脂肪酸，如亚麻酸、亚油酸等。此外，南瓜籽油还含有植物甾醇、氨基酸、维生素、矿物质等多种生物活性物质，尤其是锌、镁、钙、磷含量极高。南瓜籽油中还含有一种可称为男性荷尔蒙的活性生物触媒剂成分，能够消除前列腺的初期肿胀，对泌尿系及前列腺增生具有良好的治疗和预防作用。
南瓜籽油包含大量类胡萝卜素和生育酚，都具有很好的抗氧化特性。类胡萝卜素是很好的维生素A来源，而生育酚则是维生素E的来源。
女性可以用南瓜籽帮助控制膀胱过度活跃，以及盆底肌肉拉伸导致的压力性尿失禁。一项研究证实南瓜子和大豆籽萃取物混合治疗这种疾病的效果更佳。而轻微反胃是唯一在该研究过程中发现的副作用。
南瓜子富含玉米黄质，这是一种保护视网膜和减缓黄斑变性过程的类胡萝卜素，这也是导致视力丧失和失明的其中一个原因。英国南安普敦大学医学研究理事会的报告指出，玉米黄质在预防和稳定黄斑变质方面的作用可能远远超出我们的想象。
南瓜子能减轻男性良性前列腺增生和女性膀胱过度活跃的影响，因此对促进睡眠和提高整体健康水平有好处。
除了提供维生素A和E等抗氧化剂以外，南瓜子油还是镁，锰，磷和锌的理想来源。南瓜籽油中的脂肪酸也能给关节提供润滑，因此有预防关节炎等疾病的功效。此外，这种油还富含植物固醇，已证实有助于降低胆固醇水平。
南瓜籽油对百日咳、产后缺乳、内痔、贫血、产后手足肿等具有特殊的效果。
将南瓜籽油与日常食用的大豆油、花生油、菜籽油等按1：5～1:10的比例混合均匀，按日常习惯食用即可达到良好的补充和均衡营养的目的。
在拌凉菜时放入少许调味或增加光泽。
