四妙丸的副作用不明显。
目前来说，四妙丸的副作用还未明确。四妙丸是中成药，一般来说，中成药的副作用会比较小，所以在使用过程中不必太担心四妙丸会给治疗过程带来副作用。但是，大家必须合理用药，使用四妙丸要注意最好按照疗程使用，一般慢性疾病或比较长时间用药的疾病就要按疗程用药，就是把一个疾病分段治疗观察，一个疗程治疗后根据情况调整药物。
1. 忌食酒、肥甘之品。由于四妙丸的药性和功效，饮酒或食肥甘之品会导致肠胃虚弱之人上吐下泻。
2. 阴虚者禁用，胃寒者、胃弱少食者慎用。
3. 孕妇由于身体体质特殊，关键是对腹中新生命的影响巨大，所以孕妇忌服。
4. 正值经期的妇女慎用，由于方中薏苡仁药性偏寒凉，正值经期的妇女服用会导致经血流失严重。
5、儿童、年老体弱者应在医师指导下服用。
6、本品应在医生指导下使用，服药期间，坚持规律服药，避免复治、难治病例发生。
