良附丸的副作用尚不明确。
良附丸主要成分是高良姜，香附，高良姜性味归经：辛，热。归脾、胃经。香附性味甘，微寒，无毒。由此可见良附丸是一种安全性较高的中成药，一般来说是没有什么副作用的，建议在医生的指导下使用。
1.饮食宜清淡，忌酒及辛辣、生冷、油腻食物。
2.忌愤怒、忧郁，保持心情舒畅。
3.胃部灼痛，口苦便秘之胃热者不适用。
4.有高血压、心脏病、肝病、糖尿病、肾病等慢性病严重者应在医师指导下服用。
5.儿童、孕妇、哺乳期妇女、年老体弱者应在医师指导下服用。
6.胃痛严重者，应及时去医院就诊。
7.服药3天症状无缓解，应去医院就诊。
8.对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。
9.本品性状发生改变时禁止使用。
10.儿童必须在成人监护下使用。
11.请将本品放在儿童不能接触的地方。
12.如正在使用其他药品，使用本品前请咨询医师或药师。
