从中医的角度来说银耳属于润肺食物，偶尔食用有清肺、润肺、化痰的功效，这是银耳含有的粘液特有的功效，但若大量食用或天天吃，这种粘液就会影响肺部的正常排泄，出现痰多症状。
从营养学的角度来说，银耳是菌类中含有膳食纤维最多的一种，少量食用或偶尔食用有促进胃肠蠕动，促进消化的功效，但若大量食用或天天吃，胃肠中膳食纤维过多，就容易出现消化不良、便秘等症状。
银耳属于寒性的食物，这类食物少量食用有清热去火功效，尤其适合在夏季炎热时期食用，或者适合热性体质的人吃，但若大量食用或天天吃，脾胃中寒气过重，会严重影响胃肠消化。尤其是女性，甚至会出现宫寒、痛经症状。
银耳汤中含有大量的黏液成分和糖分，在食用之后血液的糖饱和度和血液粘度都会明显增加，引起银耳汤不适合高血脂、高血压、高血糖的患者食用，以免增加血糖浓度和血液粘度，加重病情。
导致肥胖
银耳最常见的食用方法是银耳莲子汤、银耳红枣汤等汤食，无论是哪种做法，都会或多或少的添加冰糖、砂糖等，少量食用对身体有好处，大量食用或天天吃，就会导致糖分摄入过多，引起肥胖症。
银耳一般比较大，很多吃银耳的人都是直接浸泡一朵，但往往一次吃不完。这种食物在常温下是最理想的菌类培养基，容易滋生菌类，就算放在冰箱中，时间超过两天也容易被菌类污染。若是天天吃，又不是天天新做的话，长期如此，容易菌类感染。
